Hey @Njörd,
wat leuk dat jullie kijken naar het produceren van bioplastics! Helaas kunnen we jullie niet helpen met het produceren van PHA mbv Cupriavidus necator, maar wat je wel kan doen is een andere soort bioplastic maken! Je kan het op het internet een methode vinden waarbij zetmeel, glycerine en azijn worden gebruikt. Afhankelijk van je hoofdvraag kan je die resultaten terug linken aan jullie eigen literatuuronderzoek.
Om een bacterie of microorganisme te laten groeien gebruiken we inderdaad vaak bioreactoren. Ondanks dat je deze zelf niet makkelijk kan gebruiken of nabootsen kan je wel nadenken over de parameters die nodig zijn om de bacterie (optimaal) te laten groeien. Denk daarbij aan temperatuur, (an)aerobe omstandighedden, pH waardes, welke soort nutrienten heeft het nodig etc etc.

Ik hoop jullie zo toch een beetje op weg te hebben geholpen.
Mocht je tegen nog meer problemen of vragen aan lopen hoor ik het graag!
Fijne feestdagen alvast!

Met vriendelijke groet,
Demi

@Lisadw

Hoi Lisa,

Wat een interessant onderwerp voor jullie PWS! Helaas is het momenteel niet mogelijk om bij ons workshops op maat te doen ivm drukte op ons Biolab. Het enige wat ik jullie nu aan kan bieden zijn de workshops!

Zouden jullie mij iets duidelijker kunnen vertellen wat jullie onderzoeksopzet is? Dan kan ik daarin wel een stuk meedenken en kijken of het ergens anders op de TU Delft wel mogelijk is. Ook kunnen we dan kijken naar eventuele aanpassingen, zodat jullie het proefje op school kunnen uitvoeren!

We zouden hier ook even over kunnen videobellen, uit mijn ervaring werkt dat een stuk sneller!

Laat maar weten wat jullie hiervan vinden!

Groetjes,
Bjorn

Beste Wieger en Hugo,
Ik heb jullie hierover privé een bericht gestuurd met wat extra informatie en een voorstel voor een vervolgstap. Kijk daar gerust even naar, dan hoor ik graag van jullie.
Met vriendelijke groet,
Isabella

Hier de link naar de enquête: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeq6U3yT98iJRI3LJZ52DmOlNUTTHPB4qbnzCn3ksv2KkwyBA/viewform?usp=dialog

@Esther-de-Burger

Hoi Esther,

Ik heb je een mailtje gestuurd met de antwoorden, omdat ik hier geen word bestand kon bijvoegen.

Groetjes,
Bjorn

Beste @IlseAerts,

Een belangrijke factor bij het kweken van de bacterien is de incubatietemperatuur. Is het voor jullie mogelijk om de petrischaaltjes te incuberen op 37 graden? Dat is bijvoorbeeld de ideale temperatuur voor het groeien van E-coli. Als bacteriebron zijn jullie goed op weg. Je kunt ook kijken naar vochtigere bronnen, zoals een keukengootsteen of vochtige bodem buiten. Ook een keukenspons of vaatdoek is een goede plek.

Je zou de bacterien kunnen aanbrengen met behulp van een steriele driehoekige glasstaaf na het pipetteren. Volgens mij gebruiken jullie nu de "Gietplaatmethode".

Honing is een levend product vol met enzymen, bacterien en sporen. Dit is ook de reden waarom honing niet geconsumeerd dient te worden door kinderen onder 2 jaar, vanwege het risico van infectie met de clostridium botulinum bacterie. (goedkope) supermarkthoning is vaak gepasteuriseerd, waarbij een groot deel van de bacterien gedood wordt. Verder is hoogwaardige manuka honing (veelal uit Nieuw Zeeland) bekend voor zijn antibacteriele werking. Mogelijk geeft dit ook een groter effect.

Ik zou de honing op de agar aanbrengen door een papieren filter te doordrenken in honing en deze ook de agar te plaatsen. Als jullie ouders toevallig koffiefanaten zijn, hebben ze misschien "aeropress filters" welke waarschijnlijk erg geschikt zijn hiervoor.

Ik hoop jullie hier een beetje mee geholpen te hebben! Als je verder nog vragen hebt, hoor ik dit graag.
Tadjiro Velzel

@bjornlosekoot

Hoi Sjors en Anne-Sophie,

Hebben jullie mijn mailtje ontvangen?

Groetjes,
Bjorn

Hoi Sara,

Wat een interessant onderwerp! We zijn momenteel bezig met het opzetten van een workshop over Bio-luminescentie, maar deze is helaas nog niet van de grond. Je kan de workshops wel in de gaten houden, want als we deze geven past dit waarschijnlijk goed bij jouw onderzoek.

Verder zou jouw onderzoek wel haalbaar kunnen zijn, maar vraag ik mij af hoe je van plan bent om aan lichtgevende algen te komen. Heb je daar al een idee bij?

Ik hoor graag van je!

Groetjes,
Bjorn

@Jessica-0

Hoi Jessica,

Wat een leuk onderwerp zeg! Heel erg goed bedacht.

Dit is opzich een haalbaar onderwerp, maar in ons Biolab hebben we helaas een beperkte beschikbaarheid en vrijheid. Hierdoor kunnen wij alleen onze workshops in ons Biolab aanbieden. Je kan bijvoorbeeld kijken naar de workshop Antibiotica. Die gaat over het effect van antibiotica op micro-organismen, zoals en waaronder E. coli (https://pwstudelft.nl/workshops/antibiotica/).

Als je wel bij jouw onderwerp wilt blijven raad ik je aan om hulp te vragen bij een onderzoeksgroep. Zij kunnen je misschien dan beter vooruit helpen. Als je hier voor kiest wil ik je wel helpen met zoeken naar de juiste mensen!

Ik hoor graag van je!

Groetjes,
Bjorn

Hoi!

Wat een tof onderwerp. Het testen van antibiotica op E.coli doen we toevallig in de workshop antibiotica, dus ik zou jullie sowieso aanraden die een keer te volgen https://pwstudelft.nl/workshops/antibiotica/. Wat betreft zelfgemaakte antibiotica wordt het wat ingewikkelder, ik weet namelijk niet zeker of die hier zomaar het lab in mogen. Dat ligt aan de samenstelling ervan. Hebben jullie toevallig al een protocol in gedachten om zelf antibiotica te maken? Dan kan ik kijken of dat een optie is.

Met vriendelijek groet,
Barbara

@CecilevR Hoi Cécile en Navdar,

Excuus voor mijn late reactie, ik heb jullie berichtje even over het hoofd gezien. Wat een tof onderwerp! Over de optimale condities van het denitrificatieproces zijn vele onderzoeken te vinden als je zoekt op scholar.google.nl en hebben jullie ook al gehoord van het Anammox proces? Als je daarop zoekt kom je sowieso veel nuttige informatie tegen. De bacteriën die gebruikt worden zijn verschillende soorten die samen het denitrificatieproces mogelijk maken. Deze zijn worden niet apart besteld, maar een mengcultuur uit de natuur wordt geïsoleerd en onderheven aan bepaalde procescondities die voor de juiste samenstelling zorgt. Zoals Baas Beckin ooit zei: 'Alles is overal, maar het milieu selecteert.' In het echt worden deze processen in hele grote waterzuiveringsinstallaties gedaan in meerdere stappen, of het op kleine schaal na te maken is, is denk ik lastig. Maar ik heb wel een docent die hierin gespecialiseerd is, hij heeft Robbert Kleerebezem, dus als je zijn naam op artikelen ziet, zit je goed ;)
Mochten jullie een keer in een videogesprek willen sparren hierover, laat het me weten, dan plannen we dat in. De vragen die ik niet kan beantwoorden zou ik aan Robbert Kleerebezem kunnen vragen.

Ik hoor graag van jullie!

Groetjes,
Barbara

Hoi Lisa en Nadia,

Bedankt voor jullie berichtje, wat een tof onderzoek dat jullie willen doen! Hoe je het beste de bodem kan meten, hangt af van wat je precies met de resultaten wil. Een pH meter is online als het goed is gewoon te bestellen, stikstof wordt wat lastiger maar zou moeten kunnen. Kunnen jullie laten weten wat jullie precies willen met de metingen aan de bodem? Dan kan ik iets beter uitzoeken wat het beste kan werken in jullie geval.

Groetjes,
Barbara

Beste @Ann-0,

Ik zou aanraden om proberen contact op te nemen met Daan Pelt en/of Ariane Briegel.
Hun contactinformatie is te vinden op de website van het Leids Universitair Medisch Centrum.

https://www.universiteitleiden.nl/medewerkers/daan-pelt#tab-1
https://www.universiteitleiden.nl/medewerkers/ariane-briegel#tab-1

Ik hoop dat je bij hen kennis en tijd kunt vinden.
Tadjiro Velzel

@Ronan Hoi Ronan!

Wat een tof profielwerkstuk en goed onderzoek dat je nu al gedaan hebt! Ik snap dat je er wat vragen bij hebt en twijfelt over hoe verder te gaan. Er zijn verschillende opties, dus ik stel voor dat we een videogesprekje plannen zodat we het samen kunnen bespreken. Dan kan ik je ook beter helpen dan hier. Kan je toevallig donderdag 30 november om 17.00?

Ik hoor het graag :)

Groetjes,
Barbara

Hoi @jula

Heb je misschien al een lijstje met de vragen voor mij? Dan kunnen we eventueel een interview plannen.

Groetjes,
Yared Pijman

Hoi Ann,

Wat een interssant onderwerp! Een practicum met bacteriofagen is inderdaad niet makkelijk uit te voeren en bieden we hier ook niet aan. Wat we wel doen is de workshop antibiotica resistentie, waarbij we aan de slag gaan met verschillende bacteriën en antibiotica. Je zou je daarvoor aan kunnen melden, zodat je in de pws in ieder geval een praktisch stukje hebt over antibioticaresistentie. Verder weet ik hier op de TU Delft namelijk geen plek waar je een proefje met bacteriofagen uit zou kunnen voeren. Dit is namelijk een duur een tijdintensief onderzoek. Mijn advies zou dus zijn om de antibioticaworkshop te komen doen en te overleggen met je begeleider of dit voldoende is voor een practisch deel in jullie pws. Over het bacteriofaag-deel kan je dan nog eventueel een theoretisch onderzoek doen.

Mochten jullie verder nog vragen hebben hoor ik het graag!

Groetjes,
Barbara

Hoi Luna!

Wat een tof onderwerp en goed dat jullie al bezig zijn met het uitdenken van een proef. Ik denk dat het goed mogelijk is om de gaajes direct op de voedingsbodem te plaatsen in de petrischaaltjes. Maar hebben jullie toevallig de linkjes voor beide versies van het experiment? Dan kan ik het iets beter vergelijken en jullie een beter advies geven. Mochten jullie verder nog vragen hebben hoor ik het graag :)

Groetjes, Barbara