Hoi Kick en Thijs,

Wat een interessant onderwerp voor jullie PWS. CRISPR-Cas is een super opkomende techniek die waarschijnlijk het hele veld van genetische modificatie omgooit. Goed dat jullie je onderzoeksvraag al toe hebben gespitst op een soort ziekte. Bij een onderzoekvraag is het namelijk belangrijk om specifiek te zijn, zodat je je onderwerp goed afbakent. Het eerste deel van jullie onderzoeksvraag zou nog wel iets meer aandacht kunnen gebruiken. 'In hoeverre' is namelijk een beetje een vage term en niet heel erg specifiek. Je zou hier bijvoorbeeld kunnen kiezen om op een specifiek deel van de behandeling. Hierbij kan je bijvoorbeeld denken aan het stadium van de behandeling of een specifieke soort behandeling (CRISPR zal voornamelijk werkzaam zijn in preventieve behandeling en minder in acute zorg). Hoe zouden jullie dit dan verwoorden?

Qua praktisch onderzoek gaat het wel lastig worden om echt iets met CRISPR te doen. Gen modificatie mag namelijk alleen gedaan worden in ML-1 laboratoria en die bevoegdheid hebben jullie helaas niet. Eigenlijk geldt dit voor alle practica die te maken hebben gen modificatie. Als jullie wel een praktisch onderdeel willen doen zou je kunnen kijken naar de Antibiotica workshop. Dat zou je nog wel kunnen linken aan mutaties in de bepaalde bacteriën.

Ik hoop jullie zo wat vooruit te helpen en hoor het graag als jullie nog vragen hebben!

Groetjes,
Bjorn

@KesvdBrand
Hoi Kes,

Wat een interessant onderwerp! Ook heel erg actueel, aangezien dierenwelzijn een steeds belangrijker punt wordt.

Ik zelf ben niet de expert die je zoekt, maar ik heb even op internet gekeken. Bij het LUMC (Leids Universitair Medisch Centrum) hebben ze een Instantie voor dierenwelzijn die verantwoordelijk is voor het welzijn van de proefdieren. Ik kon niet vinden wie daar precies bij zitten, maar je kan ze bereiken op die mailadres: IvDLeiden@lumc.nl.
Bij het Amsterdams Universitair Medisch Centrum maken ze ook gebruik van dierproeven. Hier zit dan dus ook eenzelfde instantie aan verbonden die je kan bereiken op openheiddierproeven@amsterdamumc.nl. Dit mailadres is specifiek voor vragen over het dierproefbeleid en heeft dus wel een grote kans om je verder te helpen!

Zelf kan je ook nog op zoek naar dit soort instanties, want deze mensen zijn echt expert op dit gebied. Jouw onderwerp sluit perfect aan bij wat zij doen.

Ik hoop je zo wat vooruit geholpen te hebben en hoor het anders graag van je!

Groetjes,

@rdstyl3

Hoi Faaria en Roda,

Ik heb al een reactie van mevrouw Plombe, dus jullie kunnen vragen naar mij sturen!

Groetjes,
Bjorn

@MHouweling2025

Hoi Mila en Yannick,

Wat een leuk onderwerp voor jullie PWS! Ik heb jullie interesse inderdaad binnen zien komen, maar helaas kan ik jullie nog geen data aanbieden. Jullie zijn helaas niet de enige die de workshop willen volgen en daarbij is het momenteel ook erg druk bij ons op het lab. Als ik een schatting zou maken zou ik zeggen dat jullie ergens eind november aan de beurt zouden komen. Het kan zijn dat het iets eerder of later is, maar dit zal ik op tijd laten weten!

Tijdens de workshop is het helaas niet mogelijk om af te wijken van het standaard protocol, dus hier moeten we helaas wel bij blijven. Wel zouden jullie kunnen kijken naar de literatuur die er bekend is over het effect van microplastics op de 3 soorten bacteriën die wij gebruiken!

Als jullie nog vragen hebben hoor ik het graag!

Groetjes,
Bjorn

@Anouk-en-Sophie

Hoi Anouk en Sophie,

Wat leuk dat jullie je PWS hierover doen en goed dat jullie mijn eerdere handleiding al hebben gevonden!

Het extraheren van salicylzuur uit wilgenbast wordt helaas wel een stuk lastiger. Ik heb even op internet rond gekeken, maar ik zag daar niet echt een standaard protocol. Dit betekent waarschijnlijk dat het wel erg lastig gaat worden om dit te extraheren. Je moet daarvoor namelijk extractie (kan door drogen en vermalen), hydrolyse en oxidatie stappen uitvoeren.

Is het voor jullie onderzoek nodig om dit te doen, of zou het ook volstaan om met online besteld salicylzuur acetylsalicylzuur te maken?

Ik hoor het graag van jullie!

Groetjes,
Bjorn

@rdstyl3

Hoi Faaria en Roda,

Wat goed dat jullie nog naar deze specialisten hebben gezocht! Het lijkt mij ook dat zij jullie goed kunnen helpen.

Ik zal beide professoren een mailtje sturen om te vragen of zij open staan tot het beantwoorden van een aantal vragen. Ik zal het aan jullie laten weten of zij hier voor open staan, dan kunnen jullie mij de vragen sturen, zodat ik deze dan weer door kan zetten!

Jullie horen nog van mij!

Groetjes,
Bjorn

@Lisadw

Hoi Lisa,

Wat een interessant onderwerp voor jullie PWS! Helaas is het momenteel niet mogelijk om bij ons workshops op maat te doen ivm drukte op ons Biolab. Het enige wat ik jullie nu aan kan bieden zijn de workshops!

Zouden jullie mij iets duidelijker kunnen vertellen wat jullie onderzoeksopzet is? Dan kan ik daarin wel een stuk meedenken en kijken of het ergens anders op de TU Delft wel mogelijk is. Ook kunnen we dan kijken naar eventuele aanpassingen, zodat jullie het proefje op school kunnen uitvoeren!

We zouden hier ook even over kunnen videobellen, uit mijn ervaring werkt dat een stuk sneller!

Laat maar weten wat jullie hiervan vinden!

Groetjes,
Bjorn

@KickL

Hoi Kick en Thijs,

Ik ga dan kijken of ik iemand voor jullie kan vinden! Ik hoop dan volgende week bij jullie terug te zijn!

Het contact hou ik nu nog liever via het vragenforum, maar als we een gesprek in zouden plannen zullen we overstappen naar de mail!

Groetjes,
Bjorn

Lisanne van Veggel

Hoi Lisanne en Teun,

Wat leuk dat jullie je PWS over antibiotica doen! Ik heb jullie al een mailtje gestuurd over mogelijke workshops, dus daar kom ik nog op terug!

Tijdens de workshop gaan we het effect van 6 verschillende soorten antibiotica meten op 3 verschillende bacteriën. Hiervoor groeien we alle drie de bacteriën in petri schaaltjes. Aan de petri schaaltjes voegen we dan antibiotica schijfjes toe. Deze schijfjes laten een bepaalde concentratie antibiotica los, waardoor de bacterie minder goed kan groeien. Als de bacterie resistent is tegen een bepaalde antibioticum dan zal je dus zien dat hij nog goed kan groeien, maar als hij niet resistent is zal er weinig groei zijn!

Dit sluit dus heel goed aan bij jullie deelvragen (vooral 2, 3 en 4). We gaan tijdens de workshop ook in op wat resistentie nou eigenlijk is en wat de verschillende werkingsmechanismen zijn van antibiotica!

Ik hoop dat dit duidelijk is, anders hoor ik het graag van jullie!

Groetjes,
Bjorn

@amywijnands

Hoi Amy,

Ik heb jullie nu een mailtje gestuurd met mogelijke data!

Ik zie jullie antwoord graag tegemoet!

Groetjes,
Bjorn

Hoi Taavi en Nout,

Hierbij het onderwerp op het vragenforum. Hier zullen we vanaf nu contact op hebben. Ik zal nog achter de mogelijkheden van lichtdetectie aangaan!

Groetjes,
Bjorn

@rdstyl3

Hoi Roda en Faaria,

Hierbij twee artikelen over de bacteriele afbraak van PFAS:

• https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S095816692400106X
  Dit artikel is wel lastig om te lezen. Ik raad jullie aan om hier Notebook LM voor te gebruiken. Dit is een AI tool waar je een artikel in kan voegen en dan vragen over het artikel kan stellen. De tool haalt dan de antwoorden alleen uit het artikel.
• https://news.ucr.edu/articles/2024/07/17/microbes-found-destroy-certain-forever-chemicals

Ik heb ook nog een bron gevonden waar het RIVM bijvoorbeeld data vandaan haalt (https://www.wur.nl/en/research-results/research-institutes/food-safety-research/analysing-food-and-feed/contaminants/monitoring-dioxins-pcbs-pfas-and-flame-retardants-in-agricultural-and-fishery-products.htm).

Dit was even een snelle zoektocht. Als jullie nog meer nodig hebben kan ik altijd nog even verder zoeken!

Groetjes,
Bjorn